Con la Resolución 5265 del 27 de noviembre del 2018, el Ministerio de Salud actualizó el listado de enfermedades huérfanas (versión 3.0) y estableció las condiciones para su uso. La norma aclara que una vez incluida una enfermedad en el listado se asignará el número de acuerdo con el orden de inclusión en forma consecutiva al último número establecido. Esta actualización estará disponible permanentemente en el repositorio institucional digital (RID) del ministerio. Con base en él se realizará la notificación de los casos de enfermedades huérfanas al Sivigila. Todos los usuarios que generan y administran registros médicos con diagnósticos de morbilidad o mortalidad deben utilizar este listado. Esta nueva norma deroga la Resolución 2048 del 2015.