El Ministerio de Salud estableció las directrices para la formulación del Programa de verificación microbiológica del sistema oficial de inspección, vigilancia y control de la carne y productos cárnicos comestibles destinados para el consumo humano. Con la Resolución 2690, la entidad señala que las autoridades definirán los microorganismos a incluir en el programa considerando el riesgo para el consumidor, la especie animal, el tipo y el establecimiento, entre otros. Inicialmente, deberá contener los microorganismos indicadores o patógenos de acuerdo con la tabla que establece la norma y que incluye: Salmonella spp y E. coli genérico. Los ministerios de Agricultura y de Salud, basados en la información de los estudios de las líneas base y el monitoreo realizado por las autoridades sanitarias, determinarán los estándares de desempeño para los microorganismos que los requieran y los tipos de productos a los cuales se aplicarán.